Los vuelos domésticos no son una forma de transporte muy popular; sin embargo, la aerolínea bandera Royal Air Maroc, tiene una amplia red de destinos dentro del país. Entre ellos está incluída Casablanca, Essaouira, Fez, Marrakesh, Rabat y Tangier.

Si bien los billetes son considerados algo caros, la aerolínea brinda descuentos del 25% a estudiantes y menores de 26 en todos sus vuelos domésticos. Esto siempre y cuando se haya comprado el billete con anticipación en alguna de sus oficinas. Reducción de precios por grupos está disponible y menores de 12 pagan mitad de precio.

La aerolínea Atlas Blue de bajo coste (subsidiaria de Royal Air Maroc) es otra opción si es que los precios de Royal Air Maroc son demasiado altos. Su cobertura también es igual de amplia que la Royal, siendo Nador y Agadir sus destinos más frecuentes.